為切實提升全面推行林長制改革成效和工作實效，云南省在全國率先建立省、州（市）、縣（市、區）三級督察體系，由三級黨委副書記和人大、政協主要領導擔任同級總督察和副總督察，按年度由各級人大、政協組織開展林長制督察。

 云南省林長制辦公室認真落實督察指示批示要求，深入研究督察反映的情況、指出的問題、提出的建議，按照“共性問題集中整治、個性問題重點關注、典型問題舉一反三”原則，將問題從“共性”和“個性”兩個維度進行梳理分類。

 針對共性問題，從省級層面研究制定具體措施，督促指導相應州（市）整改；針對個性問題，上下聯動制定問題清單、責任清單和措施清單，一體推進整改銷號，并督促各州（市）黨政領導干部層層壓實保護發展森林草原資源主體責任，推動各級林長切實履職盡責，以更鮮明的態度、更堅定的決心、更有力的措施，確保督察整改事事有回音、件件抓落實。2023年度省人大、省政協林長制督察指出的問題，已于2024年1月底，在16個州（市）的合力整改和省政府督查室的有力指導下，作“辦結”處理。