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依據監測周期數據，評選十二個獎項的獲獎者和入圍者。在一個監測周期，一位觀察員可參加多個獎項角逐，按最好成績確定一個獎項頒獎。

1.數字標本熱搜獎：物種觀察員熱搜排名第一即為獲獎者，熱搜排名第二至十一，即為入圍者。熱搜榜分為總榜和競賽榜，競賽榜開始于2024年1月1日0時，結束于2025年12月31日24時。

2.數字標本記錄獎：以制作合格數字標本多少為序，取前11名。

3.數字標本組織獎：以發展合格觀察員多少為序，取前11名。連續三個月，每月發布一幅物種卡即為合格觀察員。

4.數字標本學術獎：以“分類采集、系統采集”為標準，評選學術獎。第一步，通過自薦、推薦以及作品點贊等方式，確定50名參賽代表，經專家初評，產生30名“獲獎候選人名單”，進行第一次公示；第二步，結合投票，接受自薦與質疑，經專家二評，產生11名“獲獎入圍者名單”，進行第二次公示；第三步，接受自薦與質疑，經專家終評，產生“標本獎獲獎者名單”，進行第三次公示。

注：暫分為12類，哺乳、爬行、兩棲、昆蟲、鳥類、魚類、喬木、灌木、藤本、草本、竹類、菌類。建議專注最熟悉的一類物種，按照一定的思路，系統化采集數字標本。請點擊《關于設立“物種學術獎”的通知》。

5.數字標本博物獎：以“監測物種涵括12類”為標準，評選博物獎。流程同學術獎。 凡制作物種卡兼顧12類物種者，直通列為“參賽代表”，按程序進入“獲獎候選人名單”。

6.數字標本藝術獎：以攝影藝術為標準評選，與“物種攝影獎”按“兩個獎項、一套班底”的模式管理。流程同學術獎。 請點擊《關于設立“物種攝影獎”的通知》。

7.數字標本家庭獎：全體成員參與數字標本制作的家庭（三口之家，每人每周至少一幅），即為候選家庭。每個家庭講述自己的物種故事，依據感染力、娛樂性，由網友投票產生獲獎者和入圍者。

8.數字標本攝像獎：以視頻表現力、生態價值、知識性、趣味性等為標準，評選攝像獎。流程同學術獎。 請點擊《關于設立“物種攝像獎”的通知》。

9.數字標本物種畫學會獎：以兼顧科學性和藝術性為標準，評選物種畫學會獎。流程同學術獎。請點擊《關于設立“物種畫學會獎”的通知》。

10.數字標本寫作獎：以文字表現力、生態價值、知識性、趣味性和插圖等為標準，評選寫作獎。流程同學術獎。 請點擊《關于設立“物種寫作獎”的通知》。

11.數字標本團體獎：依據雙基建設成績，由領導評選。請點擊《數字標本團體獎參賽指南》。

12.數字標本巡護獎：以發布合格物種隨拍篇數多少為序，取前11名。請點擊《關于設立“物種巡護獎”的通知》。